در شرایطی که پرسپولیس مرحله گروهی لیگ قهرمانان را بعد از اپیدمی کرونا با قعرنشینی شروع کرد، عیسی آل کثیر یکی از بازیکنانی بود که تاثیر زیادی در صعود و البته حضور این تیم در مرحله نیمه نهایی لیگ قهرمانان داشت. او البته در مرحله یک چهارم و در جدال با پاختاکور ازبکستان به دلیل شادی گلش که از سوی کنفدراسیون فوتبال آسیا با اتهام توهین نژادی مواجه شد، محرومیتی شش ماهه را متحمل شد و از حضور در نیمه نهایی و بعد از آن فینال دور شد.
آل کثیر اکنون با پشت سر گذاشتن دوره محرومیت شش ماهه، بار دیگر با شروع لیگ قهرمانان به ترکیب این تیم بازگشته و آمادگی خود را در جدال با نساجی با گلزنی در ثانیه‌های پایانی به نمایش گذاشت. او اکنون یکی از مهره‌هایی است که یحیی گل محمدی امیدوار است با نمایش درخشان خود در کنار دیگر مهره‌های تهاجمی تیمش، مسیر صعود را در هند هموار کنند.
